RightField

説明

RightField は、各注釈フィールドに対して、選択されたオントロジー (サブクラス、個体、または組み合わせ) から許可される用語の範囲を指定できます。結果のスプレッドシートでは、これらの用語が単純なドロップダウン リストとしてユーザーに表示されます。これにより、サードパーティではなくデータを生成した科学者によって注釈が作成され、データ収集時に注釈が収集されるため、コミュニティオントロジーを使用するための採用障壁が減少します。

RightField は、Microsoft ドキュメントとのやり取りに Apache-POI を使用するスタンドアロンの Java アプリケーションです。これにより、ユーザーは Excel スプレッドシートをインポートしたり、新しいスプレッドシートを最初から生成したりできます。オントロジーは、ローカル ファイル システムから、または BioPortal オントロジー リポジトリからインポートできます。個々のセル、または列全体または行全体を必要な範囲のオントロジー用語でマークでき、個々のスプレッドシートに複数のオントロジーからの用語で注釈を付けることができます。

マークアップして保存すると、RightField 対応のスプレッドシートには、注釈で使用されるオントロジーの起源とバージョンに関する情報を含む「隠し」シートが含まれます。この来歴情報は、将来オントロジーが変更された場合に重要です。これにより、既に選択されている値が非推奨になるか、よりきめ細かいオプションが追加され、再アノテーションが促される可能性があります。 RightField は、管理者のツールとして意図されています。用語をさらに標準化するために、特定のテンプレートに既に準拠しているスプレッドシートを拡張します。