CodonCode Aligner

説明

CodonCode Aligner は、DNA 配列のアセンブリ、アラインメント、コンティグ編集、および突然変異検出のための使いやすいソフトウェアです。 Aligner は Phred-Phrap と互換性があり、シーケンス品質スコアを完全にサポートし、使い慣れた使いやすいユーザー インターフェイスを提供します。機能には、テキスト ファイルからの配列のインポート、トレースへのリンクを維持しながらコンティグを相互に整列させる、ヘテロ接合変異の検索、関心領域 (「機能」) の定義、Phrap で生成されたアセンブリのインポートと編集、配列と機能のエクスポート、配列のインポートが含まれます。 ABI および SCF ファイルから、ベクター トリム、リファレンス シーケンスへのアラインメント、ヘテロ接合体の挿入と削除の分析、ユーザー定義の機能間での移動、および Consed 互換のアセンブリ プロジェクトのエクスポートを行います。