compsort for Mac

説明

相対的な違いを使用してコンマ区切りのデータ ファイルを比較し、最も類似したコンフォメーションを決定するためのコマンド ライン ツール。 Compsort は、相対差を使用してデータ ファイルを比較し、類似性スコアを計算し、スコアを昇順で並べ替え (値が小さいほど類似性が高いことを表します)、X 個の低いスコアを保存します。

ユーザーが作成するデータ ファイルは、カンマ区切りのテキスト ファイルである必要があります。各ファイルは、一意の分子を表します。ファイル内の各行は、分子の固有の配座を表します。データ ファイルの最初の列は、行によって表されるコンフォメーションに固有のラベルでなければなりません。残りの列は、距離空間の測定値などの数値記述子です。

行は、ファイル間で組み合わせて比較されます。比較対象のラベルは連結され、行セットのスコアとともに保存されます。これにより、特定の類似性スコアを生成したコンフォメーションを特定する方法が提供されます。

今後の作業は次のとおりです。

GUI インターフェイスの追加

私の 3D ファーマコフォア モデリング アルゴリズムに関する論文を投稿する

MPI を使用した並列バージョン