codonPhyML

説明

codonPhyML は、系統発生の再構築において進化のマルコフ コドン モデルを使用します。入力として DNA 配列によって特徴付けられる種のセットが与えられると、codonPhyML はそれらの進化的関係を最もよく説明する系統樹を返します。 NNI および SPR ツリー トポロジ検索ヒューリスティック、最尤推定による置換率パラメーター、および OpenMP によるマルチコア サポートを備えています。