GenoSuite

説明

GenoSuite は、プロテオゲノミクス解析用に開発されたフレームワークです。 FDRScore ベースの戦略を使用して、複数の検索アルゴリズムからの結果を統合します。 Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) は、GenoSuite フレームワークの一部として開発されています。 PPT は、原核生物のゲノムで新しい翻訳を見つけるためのもので、質量分析に基づくプロテオミクス データと関連するゲノム配列に依存しています。機能には、ペプチド同定のためのデータベース検索を実行するための 4 つのオープン ソース アルゴリズムが含まれており、4 つのアルゴリズムの任意の組み合わせを選択でき、ゲノム検索固有のペプチド (新規ペプチド) を一覧表示し、品質評価のためにスペクトルの一致を視覚化できます。新規タンパク質と既存のタンパク質注釈の変更、および新規ペプチドの視覚的なゲノム コンテキストも生成できます。