MultiGeneBlast

説明

MultiGeneBlast は、NCBI GenBank タンパク質エントリの FASTA ヘッダーの再フォーマットに基づくオープン ソース ツールであり、これを使用してソース ヌクレオチドと座標を追跡できます。 MultiGeneBlast は、合成生物学プロジェクトのこのような多重遺伝子部分の検出に役立ちます。その出力に基づいてオペロンの合成ライブラリを作成し、ユーザーが希望する機能に最も近い機能を持つオペロンを特定できます。このツールは、各遺伝子に対する単一の BlastP 実行の結果を組み合わせ、ヒット数、シンテニー保存、および累積 Blast ビット スコアによって任意の GenBank エントリからゲノム領域をソートすることにより、すべての相同ゲノム領域を識別する機会を提供します。アーキテクチャ検索を実行して、ユーザーが指定したアミノ酸配列の任意の組み合わせに対する Blast ヒットを含む任意のゲノム領域を見つけることができます。