proTRAC

説明

proTRAC は、確率的 piRNA クラスターの検出、可視化、および分析のためのユニークで便利なツールです。 proTRAC は、これまでに適用されたクラスター検出方法と比較して、より高い感度と選択性を示しています。観測されたシーケンスリードヒット密度、ストランドバイアス、まれにマッピングされたシーケンスリードに対応する遺伝子座の量、位置 1 に T または位置 10 に A を持つ遺伝子座の量、および典型的な piRNA の長さの範囲内の遺伝子座の量 (26- 32nt) が考慮されます。クラスター候補の観測された特性は、指定されたデータセットに照らして評価され、確率論的スコアリング システムの対象となります。