InDelFixer

説明

InDelFixer は、次世代シーケンス データから挿入または削除を引き起こすフレーム シフトを除去する Java プログラムです。場合によっては、目的のタンパク質にフレーム シフトを伴うバリアントがないことが知られています。これらのフレーム シフトは、特定の参照ゲノム (または将来のバージョンではマルチプル アラインメント) で修正できます。このプログラムは、標準フローグラム形式のファイル、FASTA/PacBio ccs ファイル、および Illumina ペアエンド データを FASTQ ファイルとして受け入れます。