POY

説明

POY は、複数の種類のデータ (形態、ヌクレオチド、遺伝子と遺伝子領域、染色体、全ゲノムなど) をサポートする系統解析プログラムです。 POY は、真のアラインメントと系統推定を実行できるという点で特に優れています。つまり、入力シーケンスを事前にアラインメントする必要はありません。挿入、削除、および再配置は、Maximum Parsimony の下の全体的なツリー スコア、または Maximum Likelihood の下のモデルに含めることができます。この目的のためにさまざまな発見的アルゴリズムが開発され、POY に実装されています。